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Oggetto:
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DIAGNOSTICA BOTANICA E MICROBIOLOGICA IN AMBITO FORENSE

Oggetto:

Diagnostic techniques used in forensic botany and microbiology

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Anno accademico 2023/2024

Codice attività didattica
CHI0180
Docenti
Sergio Enrico Favero Longo (Titolare)
Mariangela Girlanda (Titolare)
Corso di studio
Corso di laurea magistrale in Chimica Clinica Forense e dello Sport D.M. 270
Anno
1° anno, 2° anno
Periodo
Primo semestre
Tipologia
A scelta dello studente
Crediti/Valenza
4
SSD attività didattica
BIO/03 - botanica ambientale e applicata
Erogazione
Tradizionale
Lingua
Italiano
Frequenza
Facoltativa
Tipologia esame
Orale
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

 

L'insegnamento si propone di fornire conoscenze  sui materiali di origine vegetale e sui microrganismi (principalmente funghi) di interesse nel campo delle indagini forensi, insieme a competenze teoriche e pratiche su tecniche microscopiche e molecolari comunemente utilizzate nella diagnostica biologica. In tale contesto verranno fornite conoscenze su elementi della biologia di piante e funghi utili per l'identificazione e la caratterizzazione di reperti.

Tali finalità contribuiscono alla maturazione di competenze in ambito biologico, previste tra gli obiettivi formativi generali del corso di laurea. Sono inoltre coerenti con l'acquisizione di competenze relative a: raccolta di campioni e informazioni di contesto, individuazione delle tecniche e degli strumenti da impiegare per il campionamento e l'analisi, svolgimento di prove in laboratorio in cui vengono utilizzate metodiche differenti di analisi.

The course aims at illustrating plant materials and microorganisms (mainly fungi) of interest in the field of Forensic Botany and Microbiology, focusing on conventional and advanced microscopic techniques and molecular protocols commonly used in biological diagnostics. Fundamentals of the biology of plants and fungi, of interest for their identification and characterization, will also be provided.

Such goals contribute to the acquisition of biological skills, which is comprised in the general objectives of the Course in "Chimica clinica, forense e dello sport". They are also consistent with the development of skills in sample collection and related information, identification of techniques and tools for sampling and analysis, conducting laboratory tests involving different analytical approaches.

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Risultati dell'apprendimento attesi

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: In coerenza con quanto previsto dai Descrittori di Dublino definiti dal corso di laurea, le studentesse e gli studenti dovranno:

-       acquisire competenze teoriche e operative in ambito biologico vegetale e microbiologico

-       conoscere le principali caratteristiche biologiche ed ecologiche dei gruppi trattati nel corso

-       apprendere i  principali metodi microscopici morfologici di analisi in campo botanico, nonchè gli approcci convenzionali e molecolari per l'identificazione di gruppi microbici d'interesse

-       imparare a riconoscere alcuni materiali di origine vegetale ed alcuni taxa microbici di rilievo nell'ambito di pertinenza

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: Oltre alla conoscenza dei singoli argomenti, è richiesta la capacità di collegare aspetti apparentemente distinti ai fini del riconoscimento delle somiglianze/differenze tra organismi e della composizione di un quadro generale.

L'acquisizione delle competenze prima specificate migliorerà le capacità di interazione con la figura professionale del biologo.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO
Al termine dell'insegnamento le studentesse e gli studenti saranno in grado di raccogliere, organizzare e interpretare dati relativi alla botanica e alla microbiologia in ambito forense.

ABILITÀ COMUNICATIVE: Gli studenti e le studentesse dovranno dimostrare di essere in possesso di una terminologia appropriata.

CAPACITÀ DI APPRENDERE

Al termine dell'insegnamento le studentesse e gli studenti avranno avuto un primo confronto con lavori scientifici di riferimento per le problematiche di botanica e microbiologia forense, acquisendo gli strumenti cognitivi per la futura consultazione  dell'ampia letteratura di settore.

KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING: Consistently with the Dublin descriptors defined by the Course in "Chimica clinica, forense e dello sport", the students will

-       acquire theoretical and practical skills in the botanical and microbiological fields

-       gain knowledge of the main biological and ecological features of the organism groups concerned

-       acquire expertise on the main microscopic and morphological methods of botanical analysis, as well as conventional (morphology-based) and molecular approaches to the identification of microbial groups

-       learn to recognize some plant materials and microbial taxa of interest

APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING: The students will be asked not only to demonstrate knowledge and understanding of single subjects, but also to be able to correlate apparently distinct topics in order to highlight similarities/differences among organisms and to depict a global view.

The acquisition of the abovementioned expertise will allow the student to better interact with biologists.

MAKING JUDGEMENTS: The students will develop evaluative judgement capacity to collect, organize and interpret data on of forensic botany and microbiology

COMMUNICATION SKILLS: The students should master an appropriate terminology.

LEARNING SKILLS: The students will have the opportunity to read exemplary scientific papers on forensic botany and microbiology, acquiring expertise for their future exploration of the wide available literature in the field

 

 

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Programma

INTRODUZIONE GENERALE al corso: Piante e funghi, un gruppo eterogeneo.

PARTE MICROBIOLOGICA:

Funghi "sensu stricto" ed organismi "fungoidi": caratteristiche generali e biodiversità. Criteri adottati nella classificazione dei funghi e illustrazione dei principali gruppi fungini.

Elementi di biologia fungina: Struttura ed ultrastruttura. Accrescimento. Differenziamento. Modalità di riproduzione sessuale ed asessuale. Nutrizione. Aspetti generali e particolari del metabolismo. Influenza dei fattori ambientali sullo sviluppo dei funghi e tolleranza agli estremi.

Principali tecniche micologiche. Metodi convenzionali (morfologici) e molecolari (barcoding) per l'identificazione dei taxa d'interesse. Allestimento di colture e preparati microscopici. Osservazione ed identificazione dei principali taxa fungini di interesse in ambito forense.

 

PARTE BOTANICA:

Generalità sui materiali di origine vegetale di interesse in ambito forense: un approccio evolutivo alla variabilità morfologica e funzionale degli organismi vegetali (Archaeplastida) e un'introduzione alle tecniche diagnostiche di riferimento. Tecniche di indagine e casi di studio, di rilevanza in ambito forense, relativi alle seguenti tipologie di organuli cellulari, cellule e tessuti vegetali: gli amiloplasti; la parete cellulare; le fibre vegetali; il legno; il polline.

Metodi di indagine microscopica. Microscopia ottica e a fluorescenza, microscopia confocale, microscopia elettronica a scansione e trasmissione. Tecniche di preparazione e colorazione o contrasto dei materiali in microscopia.

INTRODUCTION: Plants and fungi, a heterogeneous assemblage.

FUNGAL PART:

True fungi and fungus-like organisms: their general features and activities. Criteria for the systematic classification of fungi and main features of the major taxa. Fundamentals of fungal biology: Fungal structure and ultrastructure. Fungal growth. Fungal differentiation Fungal nutrition. Fungal primary and secondary metabolism. Influence of environmental factors on fungal survival/growth.

Main mycological techniques. Conventional (morphology-based) and molecular (barcoding) methods techniques for the identification of fungal (microbial) taxa. bservation and identification of the main fungal taxa of interest in Forensic Microbiology. Setup of fungal cultures and microscopic slides.

PLANT PART:

Bases on materials of plant origin of interest in the field of Forensic Botany: an evolutionary approach to the morphological and functional diversity of plants (Archaeplastida) and an introduction to diagnostic techniques. Investigation approaches and case studies of forensic interest dealing with the following plant organelles, cells and tissues: amyloplasts, cell wall, fibers, wood, pollen.

Microscopic methods of investigation. Light and fluorescence microscopy, confocal microscopy, electronic scanning and transmission microscopy. Staining techniques in microscopy.

 

 

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Modalità di insegnamento

Il corso prevede 32 ore di lezioni frontali e teorico-pratiche, equamente distribuite fra la parte microbiologica e quella botanica. 

Le lezioni saranno svolte in presenza 

Indicazioni operative dettagliate sull'organizzazione delle attività in presenza saranno fornite in prossimità dell'inizio delle lezioni.

 

The course consists in typical and theoretical-practical lectures (32 hours), equally distributed between the fungal and plant parts. 

The lessons will be in presence 

Details on the practical organization of lessons in presence will be provided in the weeks before their starting.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

L'esame consiste in una verifica orale, con domande relative ad entrambe le parti del programma (parte botanica e parte microbiologica).

Parte microbiologica: vengono formulate due domande relative ad elementi della biologia dei microrganismi e alle caratteristiche dei principali taxa d'interesse.

Parte botanica: vengono formulate due domande relative alle tecniche diagnostiche e ai materiali di origine vegetale trattati durante le lezioni teoriche.

A partire da tali domande principali possono essere richiesti specifici chiarimenti/approfondimenti, in particolare in riferimento agli elementi di interesse per l'ambito forense.

Al termine dell'esame ciascuna delle docenti formula un voto (espresso in trentesimi) relativo alla parte di pertinenza; il voto complessivo consiste nella media dei due voti. L'esame è superato se viene raggiunta la sufficienza (18/30) in entrambe le parti.

In caso di eventuali disturbi dell'apprendimento, si invitano studenti e studentesse a prendere contatto con i docenti per concordare  modalità d'esame idonee.

L'esame orale è previsto in presenza. 

The examination is an oral test focusing on both parts of the syllabus (plant part and fungal part).

Fungal part: The student will be asked two questions dealing with fundamentals of microbial (fungal) biology and with features of the main taxa illustrated during the course.

Plant part: the student will be asked two main questions dealing with microscopy techniques and the plant materials illustrated during the course.

For either part, the two main questions may represent the starting point for specific clarifications, particularly focusing on knowledge of forensic interest.

At the end of the examination each of the two lecturers will give a mark related to the respective part of the syllabus; the final result will be the average of the two marks. In order to pass the exam, the student has to get a pass mark (at least 18/30) for both parts.

Students affected by learning disability are invited to get in touch with the lecturers in order to agree on  an appropriate modality for the examination.

Exams are planned in presence.

 

Testi consigliati e bibliografia

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Durante le lezioni i docenti forniranno materiale didattico in formato elettronico.

Il materiale didattico (pdf delle slide e registrazioni per la didattica a distanza) sarà caricato sulla piattaforma moodle.



Registrazione
  • Chiusa
    Apertura registrazione
    04/12/2023 alle ore 00:00
    Chiusura registrazione
    31/01/2024 alle ore 23:55
    Oggetto:
    Ultimo aggiornamento: 04/12/2023 10:10
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